Entenda o CABGen:
Missão e Propósito

O CABGen surge como uma solução para os desafios enfrentados diante do aumento exponencial de dados gerados pelo sequenciamento genômico de bactérias resistentes aos antimicrobianos (RAM). Em resposta à urgência em combater a RAM e preencher a lacuna entre a geração e análise de dados genômicos, o CABGen oferece funcionalidades essenciais, como identificação de espécie, detecção de genes e mutações relacionadas à resistências, atribuição de um perfil clonal e a verificação da existência de plasmídeos. Essas ferramentas simplificam e aprimoram a análise e interpretação de dados biológicos, fornecendo insights valiosos para aplicações clínicas.
Ademais, o sistema está em constante evolução para atender às demandas crescentes, com planos para a instalação de um novo servidor que permitirá até 60 análises em paralelo, além de um armazenamento robusto capaz de suportar até 120 mil amostras. A segurança do CABGen é garantida tanto pelo firewall da rede do Programa de Computação Científica (PROCC) quanto pelas rigorosas políticas de segurança da FioCruz.

CABGen logo

Por dentro do CABGen

cabgen pipeline

Resultados do CABGen

cabgen result example

Ana Paula D'Alincourt Carvalho Assef
Responsável por coordenar o projeto, analisar os resultados fenotípicos, moleculares e de sequenciamento e enviar os resultados para o sistema Gerenciamento de Ambiente de Laboratório (GAL).
Fabrício Alves Barbosa da Silva
Responsável por gerenciar a utilização do servidor da Fiocruz para montagem de genomas e desenvolvimento do banco de dados para disponibilização de genomas.
Felicita Mabel Duré Pérez
Doutoranda do Programa de Biologia Computacional e Sistemas do Doutorado em Ciências da Saúde Cooperação internacional entre a Fundação Oswaldo Cruz e o Focem-Mercosul - Paraguai.
Melise Chaves Silveira
Responsável pela análise dos resultados obtidos no sequenciamento de todo o genoma.
Rodolpho Mattos Albano
Pesquisador da UERJ.
Cláudio Marcos Rocha de Souza
Responsável pelo gerenciamento das atividades laboratoriais do LAPIH e liofilização e armazenamento de amostras bacterianas.
Nicolas da Matta Freire Araujo
Responsável pelo desenvolvimento da nova versão do front-end do CABGen.

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